MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 15937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	ATAA	2	8	15	22	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008345	TGC	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008345	CTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008345	GA	3	6	3704	3709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008345	GTCT	2	8	7307	7314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008345	A	6	6	7359	7364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008345	A	7	7	7374	7380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008345	CTA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008345	T	6	6	10494	10499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008345	TAA	2	6	10507	10512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008345	TTA	2	6	11100	11105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008345	CTTA	2	8	11150	11157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008345	ACA	2	6	14510	14515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008345	GACA	2	8	14533	14540	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008345	GTTT	2	8	14548	14555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008345	TTAT	2	8	14557	14564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008345	AACA	2	8	14566	14573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008345	TATC	2	8	15347	15354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008345	TAT	3	9	15427	15435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008345	T	6	6	15435	15440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008345	AGA	2	6	15483	15488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008345	TAAAA	2	10	15493	15502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008345	A	8	8	15499	15506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008345	CAG	2	6	18984	18989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008345	ACA	2	6	19045	19050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008345	T	6	6	19073	19078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008345	ATC	2	6	19079	19084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008345	GCA	2	6	21123	21128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008345	GTT	2	6	23208	23213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008345	TGT	2	6	23224	23229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008345	AGT	2	6	23238	23243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008345	TA	3	6	23577	23582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008345	CAT	2	6	23640	23645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008345	AT	3	6	23670	23675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008345	T	7	7	23719	23725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008345	AAT	2	6	23748	23753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008345	TCA	2	6	24343	24348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008345	T	6	6	29521	29526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008345	TAA	2	6	30148	30153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008345	GTT	2	6	31300	31305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008345	CAA	2	6	31339	31344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008345	AGG	2	6	32855	32860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008345	CCT	2	6	32866	32871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008345	T	6	6	32871	32876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008345	GGAA	2	8	33495	33502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008345	TTA	2	6	35481	35486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008345	ATT	2	6	35540	35545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008345	ATC	2	6	40636	40641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008345	A	6	6	40648	40653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008345	GTA	2	6	40657	40662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008345	A	6	6	40710	40715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008345	AAT	2	6	40749	40754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008345	ATA	2	6	40761	40766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008345	TA	3	6	40791	40796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008345	ATT	2	6	40842	40847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008345	TAT	2	6	40848	40853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008345	A	6	6	41564	41569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008345	GTG	2	6	41588	41593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008345	AAAG	2	8	41686	41693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008345	A	6	6	41698	41703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008345	TG	3	6	41821	41826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008345	TCT	2	6	41859	41864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008345	TTC	2	6	41866	41871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008345	A	6	6	41887	41892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008345	ATT	2	6	41939	41944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008345	TTC	2	6	41949	41954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008345	TAAT	2	8	41961	41968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008345	A	7	7	42006	42012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008345	GGC	2	6	42053	42058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008345	GCG	2	6	42117	42122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008345	AGG	2	6	42212	42217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008345	CGA	2	6	42292	42297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008345	GAT	2	6	42317	42322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008345	GCA	2	6	42366	42371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008345	GT	3	6	42419	42424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008345	GAA	2	6	42425	42430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008345	GGA	2	6	42461	42466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008345	TAA	2	6	42479	42484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008345	AGA	2	6	42508	42513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008345	CAG	2	6	42534	42539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008345	G	6	6	42681	42686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008345	GGA	2	6	42725	42730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008345	GGC	2	6	42745	42750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008345	GAA	2	6	42988	42993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008345	AGA	2	6	43017	43022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008345	TGC	2	6	43064	43069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008345	GTC	2	6	43076	43081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008345	TGG	2	6	43154	43159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008345	GGA	2	6	43190	43195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008345	GAC	2	6	43203	43208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008345	TCA	2	6	43215	43220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008345	AC	3	6	43241	43246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008345	CGT	2	6	43309	43314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008345	AC	3	6	43410	43415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008345	AAG	2	6	43446	43451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008345	CAC	2	6	43480	43485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008345	CCT	2	6	43551	43556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008345	CA	3	6	43608	43613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008345	CTT	2	6	43627	43632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008345	AC	3	6	43648	43653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008345	GTT	2	6	43670	43675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008345	ACTA	2	8	43702	43709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008345	ATG	2	6	43721	43726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008345	TG	3	6	43740	43745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008345	A	6	6	43828	43833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008345	CTCTT	2	10	43905	43914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_008345	TAA	2	6	44009	44014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008345	TAA	2	6	44040	44045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008345	GGA	2	6	44159	44164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008345	TAG	2	6	44188	44193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008345	GCGA	2	8	44196	44203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008345	G	6	6	44345	44350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008345	TCC	2	6	44355	44360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008345	CTGA	2	8	44375	44382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008345	GGA	2	6	44665	44670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008345	TAC	2	6	44869	44874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008345	GACA	2	8	44881	44888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008345	AAC	2	6	44919	44924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008345	AGC	2	6	45009	45014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008345	CAT	2	6	45015	45020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008345	AAAG	2	8	45023	45030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008345	AGTCG	2	10	45045	45054	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008345	ACC	2	6	45087	45092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_008345	TGAAGG	2	12	45150	45161	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008345	GA	3	6	45362	45367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008345	AGGCT	2	10	45374	45383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008345	GCG	2	6	45387	45392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008345	GGT	2	6	45411	45416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008345	TGA	2	6	45473	45478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008345	TGA	2	6	45492	45497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008345	AGT	2	6	45498	45503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008345	TCT	2	6	45526	45531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008345	GGT	2	6	45572	45577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008345	GA	3	6	45602	45607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008345	GCT	2	6	45660	45665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008345	ATTG	2	8	45805	45812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008345	CGG	2	6	45853	45858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008345	ATG	2	6	45929	45934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008345	ACC	2	6	46124	46129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008345	TGG	2	6	46184	46189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008345	TCC	2	6	46210	46215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_008345	GGA	2	6	46227	46232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008345	GGT	2	6	46347	46352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008345	CGG	2	6	46434	46439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008345	TCA	2	6	46462	46467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008345	CGT	2	6	46542	46547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008345	GAT	2	6	46582	46587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008345	GCT	2	6	46596	46601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008345	CT	3	6	46753	46758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008345	ACT	2	6	46774	46779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008345	GT	3	6	46795	46800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008345	ATT	3	9	46956	46964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008345	GAA	2	6	46976	46981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008345	CAC	2	6	47029	47034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_008345	T	6	6	47174	47179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008345	TTG	2	6	47191	47196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008345	TG	3	6	47230	47235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008345	CTC	2	6	47257	47262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_008345	TGA	2	6	47332	47337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008345	T	7	7	47344	47350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008345	TGA	2	6	47356	47361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008345	TCA	2	6	47413	47418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_008345	AT	3	6	47495	47500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008345	CGA	2	6	47612	47617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_008345	GT	3	6	47713	47718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008345	TAA	2	6	47737	47742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_008345	TACTT	2	10	47787	47796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_008345	AT	3	6	47826	47831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008345	TTA	2	6	51277	51282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_008345	TATC	2	8	51326	51333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_008345	TGTT	2	8	53169	53176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_008345	A	7	7	53255	53261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_008345	A	7	7	54376	54382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_008345	AAT	2	6	55941	55946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_008345	CAT	2	6	56785	56790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_008345	TAA	2	6	56795	56800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_008345	TCA	2	6	58550	58555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_008345	TGA	2	6	58582	58587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_008345	ATT	2	6	59500	59505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_008345	T	6	6	90019	90024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008345	T	6	6	91434	91439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_008345	TGA	2	6	92325	92330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008345	TTG	2	6	92396	92401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008345	ATG	2	6	92408	92413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008345	AAC	2	6	92424	92429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_008345	TAT	2	6	92465	92470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_008345	TTTA	2	8	92492	92499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008345	T	8	8	92525	92532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_008345	ACA	2	6	95708	95713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_008345	A	8	8	95858	95865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008345	T	6	6	97616	97621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_008345	CA	3	6	143256	143261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
423	NC_008345	AGAA	2	8	143273	143280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_008345	TACA	2	8	143594	143601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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448	NC_008345	TAC	2	6	144852	144857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_008345	AAC	2	6	144902	144907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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461	NC_008345	TGA	2	6	145456	145461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_008345	TGA	2	6	145475	145480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_008345	AGT	2	6	145481	145486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_008345	GGT	2	6	145555	145560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_008345	TCGAT	2	10	152166	152175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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